Od úsvitu vekov ohrozuje ľudstvo katastrofa zvaná Hluk. Keď sa to stane, ľudia zomierajú a neexistujú žiadne protiopatrenia. Okrem jedného... Prísne tajný systém Symphogear, schopný eliminovať hluk, bol nasadený v Japonsku. Neznáma široká verejnosť, dvojica dievčat ovládajúcich Symphogears sa neúnavne snaží chrániť spoločnosť pred pustošením Noise. O to viac by ľudí prekvapilo, keby vedeli, že ich ochrancami nie je nikto iný ako spevácke duo Zwei Wing: Amou Kanade a Kazanari Tsubasa. Tachibana Hibiki a Kohinata Miku sú dve normálne dievčatá, ktoré sa práve zapisujú na Lydian Private Music Academy. Tam sa stretnú s Tsubasou a zapoja sa do boja proti Noise.