Písal sa rok 1939, keď sa objavili Neuroi. Nikto nevie, odkiaľ prišli, ani aká je ich konečná agenda, ale faktom zostáva, že ich útoky vyhnali ľudí z ich miest.  Aby proti nim zbrane vzali, ľudstvo vyvinulo novú zbraň proti Neuroi s názvom Striker Unit. Toto nové zariadenie, ktoré používa silu mágie na boj proti príšerám, vylepšuje a zosilňuje silu ženských držiteliek mágie. Na používanie tohto zariadenia sa spojili mladé čarodejnice z celého sveta a vytvorili elitnú jednotku pracovnej skupiny s názvom 501. spoločné stíhacie krídlo, bežne známej ako Strike Witches.