Ageha Jošina je sebevědomý středoškolák, který za poplatek pomáhá ostatním. Cestou z jedné zakázky najde v telefonní budce podivnou telefonní kartu s nápisem „Psyren“ a rozhodne se si ji nechat, aniž by tušil její účel. Hned následujícího dne Ageha zjistí, že jeho spolužačka Sakurako Amamija má stejnou kartu. Když se jí na to zeptá, Sakurako ho požádá, aby ji zachránil, což předznamená den, kdy začínají jeho potíže. Ageha je z okolností tohoto setkání zmatený a uvědomí si, že něco není v pořádku, když se Sakurako ztratí. Ve snaze zjistit, co se děje, se rozhodne vytočit číslo uvedené na kartě. Tajemný hlas mu položí sérii otázek zakončenou poslední, záhadnou otázkou: „Chtěl bys jít do Psyrenu?“ Tím začíná účast dvou teenagerů ve hře na život a na smrt v podivném světě obývaném monstry zvanými Taboo. Obdařeni schopností používat psychické síly známé jako PSI bojují o to, aby se vrátili na místo, které nazývají domovem.