"Pure Illusion" je označení pro nejrůznější dimenze, které se prolínají s tou naší skrze prostor a čas. Zde se na nejrůznějších místech skrývají tajemné fragmenty, které, pokud jsou sesbírány, mohou splnit jakékoli přání. Po těchto fragmentech pátrá hned několik tajemných organizací, které si touží splnit své sny. V jedné z těchto organizací se díky sérii nečekaných okolností potkávají dvě mladé dívky - energická Papika a vcelku normální a klidná Cocona. Anime Flip Flappers sleduje příběhy této dvojice na nejrůznějších fantastických místech, jejich sílící přátelství a společnou cestu za splněním svých snů...