Toosaka Rin a Luviagelita Edelfelt jsou mágové z Hodinové věže, ústředí Asociace mágů, a její ředitel je poslal do města Fuyuki, aby sbírali karty tříd, z nichž každá má pravomoci služebníka z války o Svatý grál. Na pomoc v jejich pátrání jim byly předány dvě mocné kouzelné hůlky, Rin obdržel kouzelný rubín a Luvia kouzelný safír.Kvůli neschopnosti obou dívek spolu vycházet však hůlky omrzely a porušily smlouvu. Ruby pak hledala nového mistra a našla ho v nic netušící školní dívce jménem Illyasviel von Einzbern. Navzdory Illyiným protestům Ruby trvala na tom, že z ní udělá kouzelnou dívku a nyní je z ní Prisma Illya. Bez znalosti kouzelnického umění a bez předchozího vlastního výcviku, protože je ve skutečnosti úplně normální mladá dívka bez vynikajících schopností, musí nyní sbírat mocné karty tříd pomocí jakékoli omezené pomoci, kterou jí Rin může poskytnout. Dokážou tito dva uzavřít příměří s Luvií a novým pánem Sapphire a spolupracovat na dosažení tohoto cíle?