Hyakkimaru je mladý muž, ktorému chýba 48 častí tela, pretože mu ich odobrali démoni pred narodením, čo mu sľúbil jeho otec Kagemitsu Daigo, aby získal vôľu ovládnuť krajinu. Keď sa chlapček narodil, chýbalo mu 48 častí tela, a preto bol opustený a hodený do rieky. Hyakkimaru vyrástol a teraz získal falošné časti tela, aby mohol eliminovať 48 démonov, ktorí boli vyrobené z jeho tela, aby získal svoje chýbajúce časti tela. Spolu s dobrodružstvom je zlodej chlapcov Dororo, s ktorým sa spriatelí.