Ben je připraven stát se hrdinou na vlastní pěst poté, co jeho sestřenice Gwen a kamarád Kevin odcestují, ale děda Max mu přesto přidělí partnera, nováčka, kadeta Rooka. Společně zkoumají tajné podzemní město mimozemšťanů a bojují proti starým a novým nepřátelům. Mezitím se Ben dostává do hledáčku tajemného lovce Khybera.